你的意思是域服务器？
如果是建好域的情况下备份的，应该是没问题的。
只是你备份之后在域上做的操作都要重新做一下了。
当然还有其他方法解决。

如果你不是域服务器，而是单纯的其他应用服务，应该没有问题。
不过可能还是有些备份后的操作需要重新做一下。