灰鸽子木马分两部分：客户端和服务端。黑客（姑且这么称呼吧）操纵着客户端，利用客户端配置生成出一个服务端程序。服务端文件的名字默认为G_Server.exe，然后黑客通过各种渠道传播这个木马（俗称种木马或者开后门）。种木马的手段有很多，比如，黑客可以将它与一张图片绑定，然后假冒成一个羞涩的MM通过QQ把木马传给你，诱骗你运行；也可以建立一个个人网页，诱骗你点击，利用IE漏洞把木马下载到你的机器上并运行；还可以将文件上传到某个软件下载站点，冒充成一个有趣的软件诱骗用户下载……

G_Server.exe运行后将自己拷贝到Windows目录下(98/xp下为系统盘的windows目录，2k/NT下为系统盘的Winnt目录)，然后再从体内释放G_Server.dll和G_Server_Hook.dll到windows目录下。G_Server.exe、G_Server.dll和G_Server_Hook.dll三个文件相互配合组成了灰鸽子服务端，有些灰鸽子会多释放出一个名为G_ServerKey.dll的文件用来记录键盘操作。注意，G_Server.exe这个名称并不固定，它是可以定制的，比如当定制服务端文件名为A.exe时，生成的文件就是A.exe、A.dll和A_Hook.dll。

Windows目录下的G_Server.exe文件将自己注册成服务（9X系统写注册表启动项），每次开机都能自动运行，运行后启动G_Server.dll和G_Server_Hook.dll并自动退出。G_Server.dll文件实现后门功能，与控制端客户端进行通信；G_Server_Hook.dll则通过拦截API调用来隐藏病毒。因此，中毒后，我们看不到病毒文件，也看不到病毒注册的服务项。随着灰鸽子服务端文件的设置不同，G_Server_Hook.dll有时候附在Explorer.exe的进程空间中，有时候则是附在所有进程中。